如何用DNAstar进行同源性分析(dnastar)

如何用DNAstar进行同源性分析

1、利用dnastar快速筛选重复序列步骤如下：打开NCBI，搜索基因。找到该序列的CDS序列，输入到序列的标准格式的文件中，点击CDS序列，复制该序列即可，输入到标准的SEQ格式中。

探针设计教程-如何设计原位杂交的探针

1、原位杂交探针的制备如下：原位杂交探针长度是100-400nt。用于原位杂交的探针可以是单链或双链DNA，也可以是RNA探针。通常探针操作的长度以100-400nt为宜，过长则杂交率减低。

2、杂交后处理 杂交完，以后的步骤不必要特意防RNA酶。弃去杂交液，载片浸入2xSSC中2×15 min。载片浸入1xSSC中55℃水浴摇动2×15 min。用含20mg/mL的RNaseA的NTE缓冲液37℃消化30分钟，以去除未结合的探针。

3、你要检测的片段你一定知道吧？让试剂公司给你合成就行啦！要是当做一个问题回答的话就更简单啦！把你要检测的片段用DnaseⅠ进行部分酶切，然后在用带有标记的dNTP进行DNA合成补齐缺口，这样带有标记的探针就合成了。

4、(2)组织与细胞的固定进行原位杂交的细胞或组织必须经过固定处理，常使用4%的多聚甲醛(3)探针对探针的设计与 *** 根据被测定的核苷酸序列来决定。

DNAstar中Seqman拼接序列使用 ***

测序结果拼接其实很简单，你看你的两个测序结果的后面应该有一段重叠区（如果测通的话），通过重叠区拼接起来就可以了。DNAman里可以自动拼接的。你说的那几个软件在百度文档里就有下载。

双向测序得到的两个序列如果有重叠区的话，那么可以做拼接。另外NCBI的blastn可以做两个序列的比较，通过blastn比较可以看两个序列有没有重叠序列。

打开.SEQ文件，可以使用DNASTAR Lasergene或View with a text editor软件打开。DNASTAR Lasergen是全面的生物医学软件，用作DNA和蛋白质序列分析、重叠群拼接和基因工程管理。

一段序列测序后，得到两个ab1文件，用Seqman进行序列拼接时发现，两条序列方向一致，怎样将其中一条弄成反向的。并且不丢失峰图。

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