doublet,用Scrublet推断单细胞实验中的doublet

单细胞交响乐12-检测Doublet

1、doubletCells() 的优点就是不需要依赖分群结果，降低了分群的影响。缺点是需要对doublets的模拟更精确，真的要保证它和真实的情况接近。

用Scrublet推断单细胞实验中的doublet

Scrublet是个基于python的预测双细胞的工具，原理如文章中示意图所示。首先定义两种doublet，植入型（ embedded）和新表型（ neotypic），前者通常是同一细胞类型双细胞，后者是不同细胞类型双细胞，Scrublet算法只用于寻找后者。

使用 doubletCluster() 将任一cluster与其他另外两个clusters的表达量进行比较，即3个cluser为一组，其中一个是query，另外两个是source。

所谓的doublet就是一个液滴中混入了多个细胞的细胞核，导致原本的多个细胞被认为是一个细胞。在10X Genomics平台，doublets的细胞比例和一次反应中的细胞数有关，细胞越多，doublet也就越多。

这一步包括 Initialize Scrublet object 相关参数是： expected_doublet_rate：预期多细胞的比率，通常为0.05-0.1。 结果对该参数不是特别敏感。

那么双胞 (doublet)为什么不在其中 ？ 在单细胞RNA测序实验中，双胞是由两个细胞产生的。它们通常是由于细胞分选或捕获错误而产生，特别是在涉及数千个细胞的基于液滴的流程中。

紧身上衣的英语词组是什么

1、紧身衣的英语词汇是Tights Tights 读音：英 [tats] 美 [tats]含义：n. 贴身衬衣；紧身衣； *** 例句：I accidentally made a ladder in my tights.我不小心把紧身衣挂抽丝了。

2、jacket，英文单词，名词、动词，作名词时意为“羽绒滑雪衫；西装短外套；短上衣，夹克；土豆皮；书籍的护封；文件套，公文夹”，作动词时意为“给…穿夹克；给…装护套；给…包上护封；〈口〉打”。

3、trench coat 风衣；战壕风衣；雨衣；战壕服；Lip coat 口红弧膜；口红护膜；持久护唇膏；红弧膜；sack coat 男便装上衣；[服装]男式便装短上衣；男便装上装；男紧身上衣。

4、Corset： Article of clothing worn to shape or constrict the torso.紧身健美装：一种贴身内衣或外部装饰，使体形美观或紧束身躯用的衣物。A long tunic made of chain mail.锁子甲用带链子的铠甲制成的紧身长上衣。

doublej品牌衣服贵吗

1、您好，不贵，因人而异吧 价格在几千，几百。说起品牌Doublet，很多人可能不熟悉，它确实不是一个大众品牌，硬要归类的话，可以说它是一个来自日本的小众潮牌。Doublet是一个日本本土品牌。

ArchR分析scATAC-seq数据(2)-用ArchR推断Doublet

1、为了开发ArchR的doublet鉴定算法并验证它的可靠性，我们将10个不同类型的细胞进行混样测序。在没有doublet的情况下，我们的scATAC-seq数据最终应该有10个不同的细胞类型。

2、scATAC分析神器ArchR初探-使用ArchR进行轨迹分析(16) peak-calling是ATAC-seq数据分析中最基本的过程之一。因为每单元scATAC-seq数据本质上是二进制的(可访问或不可访问)，所以我们不能在单个单元上peak-calling。

3、scATAC分析神器ArchR初探-使用ArchR进行轨迹分析(16) 由于 稀疏性， 使用scATAC-seq降低尺寸具有挑战性的数据。在scATAC-seq中，可以在一个等位基因(两个等位基因或一个等位基因) *** 问特定位点。

4、scATAC-seq数据分析一个与生俱来的挑战就是在基因组浏览器上可视化聚类间的染色质开放水平。传统做法是，先对scATAC-seq的fragments进行分组，然后构建一个基因组覆盖度的bigwig文件，最后对track进行标准化后才能实现定量层面上的可视化。

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